قال شقيق الشهيد محمد الزواري "رضوان  الزواري " لموقع الجزيرة مباشر :تم استدعاؤنا للأمن التونسي لأخذ أقوال العائلة وقالوا هناك تطورات في القضية وهناك أمر هام، فالتعاطي الحكومي مع القضية متذبذب وهزيل وإلى الآن يحاولون الاستهتار بالشهيد وكأنه  شخص كان يتحرك في السر وغامض  رغم أنه عندما كان يقوم بتجارب الطائرة بدون طيار كان يعلم سلطات الأمن  واخى عضو في الهيئة العليا للباحثين للطاقة فكيف يقولون إنه أنسان غامض ولا نعرف عنه شيئا.
ويؤكد الزواري" أخي أنجز مشروع غواصة بالتحكم عن بعد طولها 6 أمتار وعرضها متر ونصف وهذا المشروع عجل باغتيال الشهيد .
ويضيف الزواري" أخي محمد سخر وقته في البحوث والدراسات وكان يعمل في صمت ولم يكن يتحدث للأسرة كثيرا ولكني لاحظت عليه عندما زرته من 15 يوما أنه كان مضطربا.
والأجهزة الأمنية تأكدت بصفة رسمية وقطعية أن قوات أجنبية اغتالت الشهيد وهذه جريمة دولة واضحة والموساد أعترف بالقضية.
 وعن تنفيذ الجريمة قال الزواري" الجناة استخدموا طريقتين للاغتيال وعندما فشلت الطريقة الأولى نفذوا الثانية وعملية الاغتيال تمت أمام منزلة عندما كان عائدا من الخارج ونحن في البلدان العربية لا نعطي قيمة للباحثين ولكن نعطي قيمة للاعبي الكرة والفنانيين.واللهِ، عند بداية الكشف عن الجريمة كانت ستأخذ منحى آخر، ولم نجد أمامنا من نلجأ إليه غير نشطاء الفيس بوك والمجتمع المدني .

هذا وعرضت قناة تونسية، صور حصرية للغواصة التي كان يعمل الشهيد التونسي محمد الزواري على صناعتها قبيل استشهاده.
وقال مقدم البرنامج على القناة التونسية، إن الشهيد الزواري والذي اشتهر بالعمل في إطار التحكم بالأجهزة عن بعد، كان يعمل على صناعة غواصة عسكرية على شكل صاروخ، لها محرك قوي؛ لاستخدامها في الأغراض العسكرية.  وأضاف: "الشهيد كان يخطط لحسم المعركة بالحرية مع العدو الإسرائيلي في أي مواجهة مقبلة".

الى ذلك، وصف راشد الغنوشي رئيس حركة النهضة اغتيال محمد الزواري بالعملية الإجرامية، واعتبرها اعتداء على الدولة التونسية وسيادتها من قبل جهاز الاستخبارات الإسرائيلية "الموساد" حسب المؤشرات الأولية، مشدد على ضرورة رفع الحكومة لقضية ضد الجهة المسؤولة ومعاقبة المجرمين.
وأوضح أن ردة فعل الحكومة بعد عملية اغتيال محمد الزواري اتسمت بالرصانة، وفق قوله.
وفي تصريح لإذاعة "صبرة أف أم" حول اداء الحكومة وتغيب النهضة عن الجنازة قال الغنوشي: "ان النهضة ليس لها علم بموضوع الزواري وعلمت به من خلال بلاغ صادر عن الداخلية". وتابع: "أنا شخصيا أول مرة اسمع باسم الزواري".
وأكد انه خلال الربع قرن الاخير لم تكن للزواري أي علاقة بالنهضة، مؤكدا انه لا يتبرأ من الزواري بل يصف الواقع، حيث ان الأخير كان يتحرك في دائرة اخرى بعيدا عن النهضة التي لا تباشر العمل المسلح، على حد تعبيره.
ونفى الغنوشي ان يكون الزواري نهضاوي لانه جزء من استراتيجية اخرى ولو استشاره لمنعه من التوجه الى العمل المسلح، وفق تعبيره.